如果哺乳期急性肠胃炎临床症状不明显，可以先观察，暂时不用任何药物，也可以正常哺乳。但饮食要清淡，最好是软温的食物，少食多餐更好，还要保证食物的安全性，以免加重急性肠胃炎。如果急性胃肠炎临床症状明显，如腹泻、恶心、呕吐、腹痛等，应暂停母乳喂养，可用奶粉代替，并积极治疗。
急性期治疗
补液是急性期最重要的治疗，补液的方法、数量和速度应根据脱水程度而定。轻度脱水患者可口服补液盐，重度脱水患者需静脉补液。情况好转后，可采用口服补液，遵医嘱补充钾、钙、锌。
药物治疗
1.肠黏膜保护剂和吸附剂:常见的蒙脱石散可吸附肠内毒素，保护胃黏膜，急性腹泻可缩短腹泻病程，减少腹泻次数。
2.益生菌制剂:由布拉氏酵母菌、鼠李糖乳杆菌、双歧杆菌等肠道益生菌组成的特殊活性微生物制剂。对病毒感染引起的水样腹泻有明显疗效，但对侵袭性细菌引起的腹泻无明显疗效。
3.抗菌药物:常用的抗生素为氟喹诺酮类，对大多数细菌性急性胃肠炎均有较好的疗效。但是，孕妇和哺乳期妇女需要告知医生，避免使用对胎儿有明显毒性的药物。他们可以选择青霉素、三代头孢如头孢曲松等对胎儿和孕妇影响不大的药物。
4.止泻药:洛哌丁胺为常用药，可抑制肠道蠕动，缓解腹泻，但对发热或明显腹痛等感染引起的炎症性腹泻和血性腹泻患者及儿童禁用。